İdari ve Mali İşler Daire Başkanlığı 124 Sayılı Yükseköğretim Üst Kuruluşları ile Yükseköğretim Kurumlarının İdari Teşkilatı Hakkında Kanun Hükmünde Kararnamede yer alan Komptrolörlük Daire Başkanlığı ile Destek Hizmetleri Daire Başkanlığının birleştirilmesiyle oluşmuş ve 1 Ocak 1993 tarihinde Üniversitemizin tüzel kişilik kazanmasıyla birlikte hizmet vermeye başlamıştır.